鐵路、水路和公路運輸是煤炭流通中的重要環節，經過近幾年不斷建設，煤炭運輸的“瓶頸”制約現象有所緩解。但是，由于我國煤炭資源分布上的缺陷，煤炭中轉流通量大、環節多，運輸對煤炭市場的影響仍然突出，近幾年煤炭價格波動也大多與運輸問題有關。今年二季度以來，運輸問題又對煤炭市場產生了新的影響。
    首先，由于年初石油價格較高，水上運輸成本增加，加之國內水運航線船舶調度上 的 障礙和船舶維修等問題，造成二季度煤炭水上運力不足，水運價格大幅度上揚。雖然目前運力緊張問題有所緩解，但近期煤炭水上運力繼續呈現供不應求局面，運價依然較高，由此造成的對上游地區煤炭價格的壓制作用仍然突出。
    另外，從今年4月份開始，受非典疫情影響，鐵路系統加強運能調整，對客運采取“減編停運”和“以貨補客”戰略，加大了煤、焦、石油、冶煉產品等大宗重點物資的運輸。5月份全國煤炭鐵路裝車日均完成39284車，同比增加3227車，增長8.95％。全國煤炭鐵路運量也出現較大幅度上升，接近2001年12月份的歷史最高水平，比上月增加577.5 萬噸，增長8.41％。與此同時，5月份主要港口煤炭中轉量完成也保持較大幅度增長，已連續兩個月增幅在兩位數以上。
    由于煤炭鐵路運輸超常規快速增長，煤炭資源已經明顯出現向中轉環節和煤炭用戶轉移傾向。電力直供電網煤炭庫存已經由4月末的1292 萬噸，增加到5月末的1508.52萬噸，同比上升14.13％；主要煤炭中轉 港口煤炭庫存已經由4月末的1043.8萬噸，增加到5月末的1188.3萬噸，同比上升20.12％。預計，鐵路煤炭運輸將繼續保持較高增長，煤炭資源向中轉環節和用戶轉移的趨勢會繼續存在。
    通過上述分析我們發現，近期煤炭市場在迎接夏季用電用煤高峰到來之際，也正面臨來自運輸方面造成的壓力：一是水上運輸價格大幅度上漲對煤炭價格的“擠壓”與“侵占”；二是煤炭產量在鐵路運輸的“ 幫助”下快速形成供應能力，使市場資源壓力加重。
    雖然目前這兩種壓力對煤炭市場的影響并未完全顯露，但預計在8 月下旬到10月之間，煤炭市場將再次步入淡季，煤炭需求將出現萎縮，如果那時運輸問題對煤炭市場的不利影響仍不能消除，煤炭市場將缺乏抵御這些風險的能力，導致煤炭價格下滑。