近年來，兗礦集團全面落實科學發展觀，推進科技創新，加快產業結構調整，轉變經濟發展方式，通過創新促進提高核心競爭力，推動集團公司又好又快發展。兗礦堅持產學研結合，健全科研機構。目前，兗礦擁有水煤漿氣化及煤化工國家工程中心、上海兗礦能源科技研發中心2個中心、1個博士后科研工作站、10個專業技術研究所和7個校企共建研究機構。煤液化及煤化工實驗室被科技部批準為國家重點實驗室。與中國化工建設集團等9家單位結成技術創新戰略聯盟，與清華大學、華東理工大學、中國礦業大學、中科院熱物理研究所、美國杜邦公司、UOP公司等國內外一流高校和企業建立合作關系，與UOP公司就煤化工技術研發、中試和推廣達成合作意向。
科技研發取得多項成果。“十五”期間承擔的煤炭間接液化、新型水煤漿氣化、燃氣發電聯產甲醇3項“863”課題全部通過國家科技部驗收，“十一五”又有100萬噸級低溫費托合成油技術等5項技術列入國家“863”計劃。“十五”以來，取得重點科技成果520項，獲省部級以上科技成果獎134項，國家專利授權102項。2006年取得重點科技成果105項，其中省部級以上成果45項，21項技術達到國際先進水平，獲得專利授權20項。
自主研發出國際上第一套兩柱掩護式放頂煤支架，向德國DBT公司轉讓專利技術有限使用權，實現向發達國家輸出先進采礦技術的歷史性突破。年產600萬噸高可靠性自動化信息化綜放工作面試生產，高溫費托合成煤液化中試裝置一次投料開車成功。醋酸專有技術、多噴嘴氣化爐技術獲得轉讓費1.2億元。“十五”期間，80％以上科技成果實現向現實生產力轉化。
科技創新離不開人才隊伍建設。近年來，兗礦通過實施人才強企戰略，樹立“人才資源是第一資源”觀念，做好了“高級管理、專業技術、高技能人才”三支人才隊伍建設，做到了人才“引得來、留得住、用得好”，為科技創新提供了堅強有力的智力保證。
加快培養高級管理人才。“走出去”學習：組織干部職工到清華、復旦等高校脫產學習，110名領導干部取得博士、碩士學位；組織科研人員參加中高層培訓，每年選派技術能手到美國、澳大利亞等國家考察學習。“請進來”培育：聘請南開大學、中國礦大等院校專家教授到公司授課，與南開大學聯合舉辦兗礦EMBA班；委托華東理工大學舉辦化工專業碩士班。
加快培養專業技術人才。一是發揮“一站兩中心”作用，結合科研項目和技術攻關，帶動和培養高級專業技術人才。二是提升現有專業技術人才素質。三是加快培養緊缺專業技術人才。四是通過到科研院所招聘、項目合作等形式，培養煤化工、煤電鋁等專業急需人才。
加快培養高技能人才。一是開展創建學習型組織、爭做知識型職工活動，培育工作學習型、生產智慧型、知識創新型職工隊伍。二是開展崗位練兵和技術比武活動，培育技術明星、崗位能手和安全標兵，多次在全國和省市技術比武中取得優異成績。三是開展職業技能鑒定工作。四是強化職工學歷教育。
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