從內蒙古自治區科技廳了解到，２００９年，內蒙古自治區與中國科學院合作實施了２０多項區院合作項目，其中部分重點合作項目取得顯著成效。

    這些重點合作項目主要有，作為推動國家煤制油能源戰略的重要工程，由內蒙古伊泰集團與中科院煤化研究所聯合研發的煤間接液化工業示范項目，于２００９年初試車成功。這個項目是我國首家擁有完全自主知識產權的間接煤制油項目，是國家“863”計劃的重點項目，也是我國煤炭間接液化完全自主技術產業化的第一條生產線。

    內蒙古神州生物技術公司與中科院微生物所合作的內蒙古航天生物基地，已在呼和浩特市托克托縣落成，雙方合作已由前期開發研究上升到了在生產基地進行生產的階段。

    ２００９年１２月上旬，由中科院、丹化集團、上海金煤化工公司投資建設，備受業界矚目的全球首套工業化示范裝置——內蒙古通遼金煤化工公司煤制乙二醇項目一期工程，順利打通全線工藝流程，生產出了合格的乙二醇產品。這個項目是我國煤化工５大重點示范工程之一。

    據介紹，內蒙古自治區政府１９９８年與中科院簽署《科技合作協議書》，２００４年續簽《全面合作協議》。